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Termindetails

TMF-Tutorials (Online)

Termin: Dienstag, 1. Dezember 2020, 09:30 - Mittwoch, 2. Dezember 2020, 18:30

Kategorie: TMF-Veranstaltungen



 

TMF-Tutorials

01. und 02. Dezember 2020 | Online

TAG 1 (01.12.2020)

 

Systemvalidierung: Das Validierungspaket der TMF (findet statt/ausgebucht)

Referent: Ronald Speer (Universität Leipzig)

01.12.2020 | 09:30 bis 18:30 Uhr (8h)

Kosten:  TMF-Mitglieder: 100 € /Nicht-Mitglieder akademische Forschung: 150 € / Industrie: 300 €

Besondere Zugangsvoraussetzungen/ Fachkenntnisse: keine

Mitzubringende Arbeitsmaterialien: keine

Die Validierung von IT-Systemen ist eine zentrale Anforderung aller behördlichen Auflagen in der medizinischen Forschung. Ohne eine lückenlose und gut dokumentierte Validierung können IT-Systeme nicht compliant sein und damit nicht die Qualität aufweisen, die die Regularien fordern. Der komplexe Prozess der Validierung setzt spezielles Wissen über die eingesetzte Hard- und Software sowie die gesamte IT-Infrastruktur voraus und erfordert die regelmäßige Beobachtung von gesetzlichen Anforderungen und Sicherheitsvorkehrungen für neue Technologien. Ein Forschungsprojekt muss nachweisen, dass die Validität der Systeme über die gesamte Einsatzdauer aufrechterhalten werden kann. Das Tutorial bietet eine Einführung in das Validierungspaket der TMF, das zusammen mit einem Validierungsmasterplan und entsprechenden Dokumenten sowie einem zugehörigen Schulungskonzept in einem TMF-Projekt erarbeitet worden ist.

 

Pseudonymisierung und Authentifizierung in medizinischen Forschungsverbünden mittels der MAGIC-Werkzeuge (findet statt/Restplätze verfügbar)

Referenten: Moanes Ben Amor, Dr. David Croft  (Deutsches Krebsforschungszentrum Heidelberg, Abt. Verbundinformationssysteme)

01.12.2020 | 09:30 bis 13:30 Uhr (4h)

Kosten:  TMF-Mitglieder: 50 € /Nicht-Mitglieder akademische Forschung: 75 € / Industrie: 150 €

Besondere Zugangsvoraussetzungen/ Fachkenntnisse: keine

Mitzubringende Arbeitsmaterialien: Docker vorinstalliert (https://docs.docker.com/install).

  1.  Zur Anmeldung

Eine zentrale Voraussetzung für den sicheren Betrieb kleiner und großer Forschungsnetze ist die rechtskonforme Verwaltung von Identitäten der Probanden oder Patienten, die anhand ihrer identifizierenden Daten standortübergreifend zu verbinden sind (fehlertolerantes Record Linkage, Pseudonymisierung). Neben Patienten sind aber auch die Identitäten und Rechte der Nutzer zu verwalten (Authentifizierung, Autorisierung).

Vorgestellt werden einerseits konkrete Anwendungen aus großen Forschungsnetzen. Der praktische Teil des Tutorials führt andererseits in die Verwendung der Mainzelliste (Identitätsmanagement) und Samply.Auth (Authentifizierungsdienst) ein, die dank DFG-Förderung in MAGIC die TMF-Datenschutzkonzepte umsetzen. Download und Informationen unter www.toolpool-gesundheitsforschung.de.

 

KNIME - Entwicklungsumgebung für Datenworkflows (findet statt/Restplätze verfügbar)

Referenten: Dr. Manuel Nietert, Liza Vinhoven (Medizinische Bioinformatik Universität Göttingen)

01.12.2020 | 9:30 bis 18:30 Uhr (8h)

Kosten:  TMF-Mitglieder: 100 € /Nicht-Mitglieder akademische Forschung: 150 € / Industrie: 300 €

Besondere Zugangsvoraussetzungen/ Fachkenntnisse: Programmierkenntnisse sind explizit nicht vorausgesetzt

Mitzubringende Arbeitsmaterialien: WLAN-fähiges Laptop

  1.  Zur Anmeldung

Die Benutzer sollen im Kurs ein generell anwendbares Software-Tool im Bereich DataScience kennenlernen und die ersten Schritte damit gehen können. Nach einer kurzen Einführung in das System und dem theoretischen Hintergrund werden wir sehr praxisnah mittels geführter Übungsaufgaben in die Benutzung dieser grafischen Workflow Plattform einweisen und die Möglichkeiten des Open-Source-Systems erörtern, u.a. für die Handhabung diverser biomedizinischer Forschungsdaten und anderer online verfügbarer Ressourcen um die Auswertungen an den Beispieldaten durchzuführen. Hierbei werden wir Ihnen genug theoretischen Hintergrund vermitteln, damit Sie verstehen, was und wieso Sie etwas in diesem Kurs tun.

 

Mehr Informationen zu KNIME unter:

https://www.toolpool-gesundheitsforschung.de/produkte/knime-analytics-platform

 

Datenschutz in der medizinischen Forschung (findet statt/ausgebucht)

Referenten: Prof. Dr. Klaus Pommerening (IZKS Mainz), Dr. Johannes Drepper (TMF e.V.)

01.12.2020 | 9:30 bis 16:30 Uhr (6h)

Kosten:  TMF-Mitglieder: 100 € /Nicht-Mitglieder akademische Forschung: 150 € / Industrie: 300 €

Besondere Zugangsvoraussetzungen/ Fachkenntnisse: keine

Mitzubringende Arbeitsmaterialien: keine

Die Konferenz der Datenschutzbeauftragten des Bundes und der Länder hat 2014 die Verwendung des TMF-Datenschutzleitfadens für medizinische Forschungsprojekte empfohlen. Das Tutorium bietet dazu eine Anleitung für Einsteiger. Präsentiert werden die verschiedenen Arten medizinischer Forschung mit den jeweils dafür zu beachtenden gesetzlichen Grundlagen, insbesondere bei langfristiger Nutzung von Daten oder Proben. Berücksichtigt wird dabei die EU-Datenschutzgrundverordnung sowie die Anpassung des nationalen Rechtsrahmens an diese Verordnung. Zudem wird das Beratungsangebot der TMF zur Erstellung konkreter Datenschutzkonzepte vorgestellt und ein Ausblick auf die aktuell gestartete Überarbeitung des TMF-Datenschutzleitfadens gegeben. Das Tutorial führt somit in das Thema Datenschutz ein und bietet eine gute Grundlage für spezialisierte Tutorials.

 

TAG 2 (02.12.2020)

 

Einstieg in Electronic Data Capture mit REDCap (findet statt/Restplätze verfügbar)

Referenten: Dr. Peter Brunecker (Charité / Berlin Institute of Health), Andreas Hetey (Berlin Institute of Health, Clinical Research Unit), Michael Krämer, (Charité / Center for Stroke Research Berlin)

02.12.2020 | 09:30 bis 18:30 Uhr (8h)

Kosten:  TMF-Mitglieder: 100 € /Nicht-Mitglieder akademische Forschung: 150 € / Industrie: 300 €

Besondere Zugangsvoraussetzungen/ Fachkenntnisse: keine

Mitzubringende Arbeitsmaterialien: Aktueller Webbrowser (z.B. Chrome oder Firefox), LibreOffice oder OpenOffice, ev. RStudio für den Advanced-Teil.

  1. Zur Anmeldung

REDCap ist eine anwenderfreundliche Webapplikation zur Erstellung und Verwaltung von Online-Umfragen und Datenbanken, insbesondere für medizinische und translationale Forschungsprojekte. Es wird an der Vanderbilt University (USA) entwickelt und über das internationale REDCap-Konsortium bereitgestellt, welches mittlerweile tausende Institutionen in mehr als hundert Ländern umfasst. Ziel des Workshops ist die Erstellung eines REDCap-Projekts für eine Longitudinal-Studie mit mehreren Events. Dazu sollen mehrere Fragebögen mit einzelnen Fragen (Items) erstellt und hinterher mit Hilfe einer Dateneingabe getestet werden. Neben der Vorstellung von REDCap wird auch auf die Rahmenbedingungen eines Einsatzes eingegangen. Je nach zeitlicher Verfügbarkeit kann auf weitere Themen wie Surveys, die Erstellung von Reports, Import- und Exportmöglichkeiten, die Anbindung von externen Programmen via API usw. eingegangen werden.

 

Einführung und erste Schritte in HL7 FHIR (findet statt/Restplätze verfügbar)

Referenten: Julian Saß, Andrea Essenwanger (Berlin Institute of Health (BIH))

02.12.2020 | 09:30 bis 18:30 Uhr (8h)

Kosten:  TMF-Mitglieder: 100 € /Nicht-Mitglieder akademische Forschung: 150 € / Industrie: 300 €

Besondere Zugangsvoraussetzungen/ Fachkenntnisse: keine

Mitzubringende Arbeitsmaterialien: Postman, Python IDE optional, weitere vorinstallierte Packages für die Durchführung der praktischen Übungen würden wir rechtzeitig vor der Veranstaltung auflisten und mit den dazu gehörigen Installationsschritten verteilen.

  1.  Zur Anmeldung

Das Tutorial startet mit einer grundlegenden Einführung in den FHIR Standard und setzt somit auch keine Vorkenntnisse voraus. Als erstes soll die Kernspezifikation vorgestellt werden, um das Gelernte anschließend in praktischen Übungen mit Postman und Python anzuwenden. Die Teilnehmer bekommen die Möglichkeit ihre eigenen FHIR Ressourcen zu erstellen, um diese dann mit Hilfe der FHIR REST API untereinander zu auszutauschen. Im zweiten Teil des Tutorials wird näher auf die FHIR Search API und das FHIR Terminologie Framework eingegangen. Zuletzt bearbeiten wir FHIR Use-Cases, wie die Implementierungsleitfäden der Medizininformatik Initiative (MII).

 

Grundlagen und Anwendungserfahrungen zu SNOMED CT (findet statt/Restplätze verfügbar)

Referenten: Cora Drenkhahn, Josef Ingenerf (Universität zu Lübeck), Pero Grgic (eHealth Suisse)

02.12.2020 | 09:30 bis 13:30 Uhr (4h)

Kosten:  TMF-Mitglieder: 50 € /Nicht-Mitglieder akademische Forschung: 75 € / Industrie: 150 €

Besondere Zugangsvoraussetzungen/ Fachkenntnisse: Grundlegende Kenntnisse zu semantischer Interoperabilität und zu SNOMED CT wünschenswert

Mitzubringende Arbeitsmaterialien: keine

  1.  Zur Anmeldung

Die eindeutige Kodierung von medizinischen Fachinhalten erfordert eine umfassende und bereichsübergreifende Terminologie. Die derzeit umfassendste Terminologie stellt SNOMED CT („Systematized Nomenclature of Medicine Clinical Terms“) dar, welche als internationaler Standard etabliert ist und eine Sicherstellung der semantischen Interoperabilität ermöglicht. Seit Mitte März ist SNOMED CT auch in Deutschland im Rahmen der Medizininformatik-Initiative (MII) verfügbar. Das Tutorial liefert im ersten Teil einen Überblick über SNOMED CT, wobei zunächst die Komponenten und grundlegenden Prinzipien unter Einbeziehung praktischer Beispiele erläutert werden. Aufbauend hierauf sollen auch komplexere Inhalte zur Sprache kommen, insbesondere die ontologischen Aspekte von SNOMED CT betreffend, sowie eine Gegenüberstellung mit Klassifikationen wie ICD-10. Ein weiterer Themenpunkt ist die Erweiterbarkeit sowie die Möglichkeit zur Übersetzung und Anpassung an nationale/lokale Anforderungen.

 

Der zweite Teil des Tutorials setzt sich mit den Anwendungserfahrungen bei der Implementierung von SNOMED CT in der Schweiz auseinander. Seit 2016 ist die Schweiz Mitglied bei IHTSDO und arbeitet in verschiedenen internationalen Arbeitsgruppen an der Weiterentwicklung von SNOMED CT mit. Seit dem Beitritt wurden über 100 Lizenzen in der Schweiz verteilt und in verschiedenen Projekten ist SNOMED CT bereits im Einsatz. Erfahrungen im Einsatz von SNOMED CT wurden im nationalen Projekt elektronisches Patientendossier gesammelt. Der Entschluss zum Beitritt bei IHTSDO, die Verwendung, Entwicklung und Verbreitung von SNOMED CT in der Schweiz sowie die Anwendungserfahrungen bei der Implementierung im Rahmen des nationalen elektronischen Patientendossiers werden in diesem Tutorial behandelt.

 

Kontakt

TMF - Technologie- und Methodenplattform für die vernetzte medizinische Forschung e.V.

Charlottenstraße 42

10117 Berlin

 

Ansprechpartner

Knut Kaulke

       

Juliane Gehrke

Programm / Inhalte

       

Veranstaltungsmanagement

Tel.: 030 - 220024749

       

Tel.: 030 - 220024717

E-Mail

       

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