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D135-01 (CandActCFTR)
Curated database of candidate therapeutics for the activation of CFTR-mediated ion conductance (CandActCFTR)
[Drittmittelprojekte | laufend] Das Projekt »CandActCFTR, eine Datenbank für Wirkstoffe, die die Funktion von CFTR bei Mukoviszidose verbessern« ist Teil der DFG-Fördermaßnahme zur »Förderung von Forschungsprojekten über die und mit der TMF«.
CandActCFTR soll eine Datenbank für Mukoviszidose-Therapeutika zur Aktivierung der CFTR-vermittelten
Ionenleitfähigkeit aufbauen, um Daten aus öffentlich zugänglichen Quellen, unveröffentlichte Primärdaten
und Erkenntnisse aus Screening-Bemühungen zusammenzuführen.
Aktivitäten und Fortschritt 2020
- Einbindung von Ähnlichkeitssuchen für Liganden
- Verbesserung der GUI
- Integration von KNIME als Teil des Backends
- Erstellung eines Systembiologiemodels nach MIRIAM-Standard
- Konzept eines Erklärfilms
Aktivitäten und Fortschritt 2021
- Einbau der Systembiologiemodellierung nach MIRIAM-Standard in die GUI
- Erstellung des Zielstrukturdatenbankmoduls
- Start des Virtuellen Screenings mit Annotation der Datenbank mit den Ergebnissen
- Erstellen einer Textminingpipeline für die automatische Vorbereitung des Kurationsprozesses
- Erklärfilm zur Software veröffentlicht
Ausblick 2022
- Fortsetzung des Virtuellen Screenings
- Schaffung von Möglichkeiten, die Systembiologiekarten interaktiv u. a. nach verschiedenen Screeningergebnissen anfärben zu können
- Einbindung der Zielstrukturenanzeige in das Webtool
- Auswahl von Testsubstanzen für den CFTRAnwendungsfall
Projektleitung:
Dr. Manuel M. Nietert, Universitätsmedizin Göttingen, PD Dr. Frauke Stanke,
Medizinische Hochschule Hannover
Projektzeitraum:
2016 – 2022
Bewilligte Mittel (Anteil TMF):
siehe »Zentralprojekt zu DFG-Forschungsprojekten über die und mit
der TMF«
Förderer:
Deutsche Forschungsgemeinschaft DFG | Projektnummer 315063128
